2000 metų gegužės 16 dieną Kaune įvyko trečiasis Baltijos šalių Vyskupų Konferencijų susitikimas, kuriame dalyvavo apaštališkasis nuncijus Baltijos šalyse ir Estijos apaštališkasis administratorius arkivyskupas Erwin Josef Ender, Rygos arkivyskupas Janis Pujats, Liepojos vyskupas Arvaldis Andrejs Brumanis, Jelgavos vyskupas Antons Justs, Rezeknės-Agluonos vyskupas Janis Bulis, Liepojos vyskupas koadjutorius Vilhelms Lapelis. Lietuvai atstovavo Vilniaus arkivyskupas Audrys Juozas Bačkis, Kauno arkivyskupas Sigitas Tamkevičius, Telšių vyskupas Antanas Vaičius, Vilkaviškio vyskupas Juozas Žemaitis, Panevėžio vyskupas Juozas Preikšas, Kaišiadorių vyskupas Juozapas Matulaitis, Šiaulių vyskupas Eugenijus Bartulis, Vilniaus arkivyskupo pagalbininkai vyskupai Juozas Tunaitis ir Jonas Boruta, Kauno arkivyskupo pagalbininkas vyskupas Rimantas Norvila, vyskupas Vladas Michelevičius ir naujai paskirtasis Telšių vyskupo pagalbininkas Jonas Kauneckas.
Posėdžio pradžioje į susirinkusius vyskupus kreipėsi apaštališkasis nuncijus E. J. Enderis, kuris savo kalboje pabrėžė, jog šiame susibūrime dalyvaująs kaip Estijos apaštališkasis administratorius. Pasveikinęs dalyvaujančius vyskupus, nuncijus kalbėjo apie galimybes artimiau bendradarbiauti su kitų šalių vyskupų konferencijomis, ypač atkreipdamas dėmesį į Skandinavijos Vyskupų Konferenciją, kuri jau kelerius metus kviečia Baltijos šalių vyskupus į savo plenarinius posėdžius, bei dalyvavimą Švedijos liuteronų Bažnyčios organizuojamose ekumeninėse iniciatyvose. Nuncijus priminė, kad šis susitikimas praktiškai sutampa su popiežiaus Jono Pauliaus II aštuoniasdešimtuoju gimtadieniu.
Baltijos šalių vyskupai nusiuntė sveikinimą Šventajam Tėvui. Gegužės 17 d. Šiluvos bazilikoje vyskupai aukojo šv. Mišias už Šventąjį Tėvą, prašydami jam Dievo globos ir stiprybės.
Nuncijaus siūlymu buvo aptarta galimybė išrinkti šio, jau tradiciniu tapusio, Baltijos šalių Vyskupų Konferencijų susitikimo pirmininką, kuris skirtų daugiau dėmesio bendram darbui koordinuoti. Posėdžio dalyvių bendru pritarimu šios pareigos patikėtos Estijos apaštališkajam administratoriui arkivyskupui E. J. Enderiui.
Kauno arkivyskupas Sigitas Tamkevičius apibūdino valstybės ir Bažnyčios santykius Lietuvoje. Jis ypač pabrėžė džiugų faktą, kad neseniai tarp Šventojo Sosto ir Lietuvos Respublikos pasirašytos sutartys, reguliuojančios katalikų, tarnaujančių kariuomenėje, sielovados klausimus, bendradarbiavimą tarp valstybės ir Bažnyčios švietimo ir kultūros srityje bei Bažnyčios juridinę padėtį. Drauge arkivyskupas paminėjo šioje srityje pasitaikančius sunkumus, ypač tai, kad kai kurie įstatymai pakankamai tiksliai neapibrėžia Bažnyčios veiklos galimybių.
Latvijos vyskupų vardu šiuo klausimu kalbėjo Rygos arkivyskupas Janis Pujats. Jis pasidžiaugė, kad Latvijos įstatymai leidžia besąlygiškai atgauti turėtą nuosavybę. Šis materialinis pagrindas suteikia daugiau galimybių sielovadinei veiklai plėtoti. Rygos arkivyskupas taip pat minėjo, kad, svarstant santykių tarp valstybės ir Bažnyčios klausimus, Latvijoje aktyviai bendradarbiauja visos tradicinės konfesijos. Savo patyrimu apie katalikiškų mokyklų veiklą Latvijoje pasidalijo Liepojos vyskupas Arvaldis Andrejs Brumanis ir Rezeknės-Agluonos vyskupas Janis Bulis.
Apie jubiliejinius renginius Lietuvoje kalbėjo Lietuvos Vyskupų Konferencijos 2000 metų Didžiojo Kristaus gimimo jubiliejaus komiteto pirmininkas Vilniaus arkivyskupas Audrys Juozas Bačkis. Jis pasakojo svečiams apie Lietuvoje jau įvykusius ir planuojamus jubiliejinius renginius, išreikšdamas viltį, kad šie Jubiliejaus metų susitikimai padės artimiau suburti tikinčiuosius ir visus geros valios žmones. Rygos arkivyskupas Janis Pujats atsakydamas kalbėjo, kad Latvijoje tokių didelių renginių kaip Lietuvoje nerengiama, ir tai savaime suprantama, nes katalikai šioje šalyje nėra dauguma. Rygos arkivyskupas ypač džiaugėsi bendromis pamaldomis, kuriose dalyvauja visų didžiųjų Latvijos konfesijų nariai. Tokie minėjimai tampa tikra švente visiems žmonėms. Šiuo metu Latvijos katalikai stato dešimt naujų bažnyčių. Jos liks Didžiojo jubiliejaus atminimu ateičiai. Kovo mėnesį buvo pašventinta pirmoji bažnyčia Aizkrauklėje, tapusi ir jubiliejine bažnyčia.
Gegužės 17 d. vyskupai tiksliau aptarė bendros veiklos galimybes, taip pat dalyvavimą dar laukiančiuose jubiliejiniuose renginiuose.
Kitą Baltijos šalių Vyskupų Konferencijų susitikimą numatoma surengti
2001 metais Taline.
Lietuvos Vyskupų Konferencijos sekretoriatas