Lietuvos Vyskupų Konferencija, sužinojusi apie teroristinį išpuolį Jungtinėse Valstijose, paskelbė tokio turinio pareiškimą:

„Lietuvos Vyskupų Konferencija, sukrėsta žiauraus teroristinio išpuolio prieš taikius Jungtinių Amerikos Valstijų gyventojus, vienijasi maldoje už žuvusiuosius su jų artimaisiais, su visais geros valios Amerikos ir pasaulio žmonėmis.

Kviečiame visus Lietuvos tikinčiuosius melstis šia intencija, taip pat prašant Dievo pagalbos išsaugoti taiką, įveikti terorizmą bei sustabdyti smurto propagandą tiek Lietuvoje, tiek ir visame pasaulyje. Yra tik vienas kelias, vedantis į tikrąją pažangą ir taiką pasaulyje, – Evangelijos nurodomas meilės kelias.

2001 metų rugsėjo 16-ąją, sekmadienį, Lietuvoje skelbiame Maldos už žuvusiuosius ir jų artimuosius bei taiką pasaulyje diena. Kviečiame tikinčiuosius ir visus geros valios žmones dalyvauti šv. Mišiose vyskupijų katedrose bei kitose Lietuvos bažnyčiose ir pasimelsti šiomis intencijomis“.

Rugsėjo 12 dieną Lietuvos Vyskupų Konferencijos pirmininkas arkivyskupas Sigitas Tamkevičius SJ pasiuntė užuojautos laišką JAV Nacionalinės Katalikų Vyskupų Konferencijos pirmininkui arkiv. Josephui Anthony Fiorenzai ir Niujorko arkivyskupui kardinolui Edwardui Michaelui Eganui. Laiške rašoma:

„Su dideliu skausmu sutikome sukrečiančią žinią apie teroristinius aktus Amerikoje. Tiek daug metų patirdavome tiktai Jūsų gerumą ir gaudavome nuolatinę pagalbą iš Jūsų šalies. Šią valandą jaučiame brolišką pareigą ir atsakomybę būti su Jumis ir Jūsų tauta, kupinais tokio sielvarto. Tiktai malda galime išreikšti savo susirūpinimą ir solidarumą. Norime Jus patikinti, kad Lietuvos tikintieji meldžiasi už Jus.

Rugsėjo 16-ąją, sekmadienį, paskelbėme Maldos už žuvusiuosius, jų gedinčias šeimas ir taiką diena. Maldaujame mūsų gailestingą Tėvą sustiprinti visą amerikiečių tautą šią tragišką valandą ir meldžiamės, kad amerikiečiai ir toliau liktų tiesa ir teisingumu besivadovaujanti tauta“.

Pareiškimą dėl tragiškų įvykių Amerikoje rugsėjo 12 dieną taip pat paskelbė Lietuvos Moterų vienuolijų aukštesniųjų vyresniųjų konferencija. Jame sakoma:

„Lietuvos Moterų vienuolijų konferencija su giliu liūdesiu sutiko žinią apie Amerikos žmonių žūtį teroristinio akto metu.

Esame viena Dievo vaikų šeima. Mūsų Viešpats Jėzus Kristus, išliedamas savo kraują ant kryžiaus, dovanojo gyvenimą visiems žmonėms. Todėl nepaprastai skaudina pasaulio nesantaika.

Klausydamos Viešpaties raginimo „budėkite ir melskitės“, prašome visų geros valios žmonių melstis, kad neplistų nesantarvė ir neįsiliepsnotų karas tarp tautų.

Rugsėjo 15 dieną (šeštadienį) visas Lietuvos vienuoles kviečiame į maldos akciją – bendrą adoraciją – už pasaulio santarvę ir taiką. Pakvieskime jaunimą, parapijiečius bei visus norinčius kartu su mumis melstis bendra intencija. Maldoje prisiminkime žuvusiuosius ir jų artimuosius. Melskimės už piktadarius, kad Dievas apšviestų jų širdis bei protus ir padėtų jiems suprasti, kokį blogį jie daro“.